Sungai Syr Darya terletak di Lembah Fergana di Asia Tengah. Sejarawan Greek menyatakan maharaja Alexander Agung dari Macedonia pernah sampai ke sini dalam usaha untuk menguasai dunia. di sinilah berlakunya Pertempuran Jaxartes. Alexander mendirikan bandar 'Alexander Timur' yang kini diubah nama kepada Khujand.Sungai ini mengalir dari banjaran gunung Tian Shan di Kyrgyzstan sepanjang 2213 kilometer.